Klíšťová encefalitida je závažné onemocnění. Postihuje nervový systém a v nejhorším případě končí smrtí. Jedinou účinnou prevencí je očkování. Podle přední české infektoložky Dity Smíškové by se k němu mělo přistupovat jako k tetanovce, kterou nikdo nezpochybňuje.