Poznávacím znamením Jupiteru je Velká rudá skvrna. Je bouří zuřící v horní části atmosféry na jižní polokouli pod rovníkem. Jak informuje Evropská jižní observatoř (ESO), astronomové však na planetě objevili druhou obří skvrnu, tentokrát tmavou. V oblasti jsou nižší teploty než v okolí, říká se jí proto Velká chladná skvrna. Tvoří ji zřejmě silná energie tamního polárního záření.