Organizace Euro NCAP Fabii poprvé otestovala v roce 2000. Už tehdy inspektoři v závěrečném hodnocení označili auto za „malý odolný vůz“. Vyzdvihovali zejména robustnost karoserie, díky které byli pasažéři velmi dobře chránění. Vysloužila si tehdy čtyři hvězdičky z pěti. Poslední model, který organizace testovala, je z roku 2021. Také ten v protokolu inspektoři chválili. Vůz dokonce označili za nejlepší ve své třídě.